相关科学研究显示：新生儿服用纯天然的深海鱼油可能会产生某些潜在疾病，不宜作为新生儿维生素 AD 的补充。同时，深海鱼油有抑制血小板凝聚的作用，若有凝血功能不全(如血友病患者)则不宜服用盐城深海鱼油，而少数过敏体质者也不能服用。肝病患者：摄入高剂量的深海鱼油可能会增加肝病患者出血的危险。对健康成年人来说，深海鱼油也不是多多益善的。有一些深海鱼油添加了脂溶性的维生素，过多摄人会导致维生素中毒等副作用。

纯天然的深海鱼油可以改善儿童的注意力分散和多动症，儿童的一些行为问题，如注意力缺陷多动障碍（ADHD），包括多动和粗心。因为omega-3是大脑的重要组成部分，所以给大脑补充足够的omega-3来预防行为问题很重要。补充深海鱼油可以改善儿童的多动，粗心，冲动和攻击性。对儿童早期教育有很大的好处。据估计，到2030年，抑郁症将成为全球第二大常见疾病。有趣的是，患有严重抑郁症的人似乎血液中都含有较低的ω-3脂肪酸。有研究表明，纯天然的深海鱼油和ω-3的补充可有效改善抑郁症。

体重指数（BMI）超过30就被定义为肥胖了。全世界约有39％的成年人超重，而13％的人肥胖。在像美国这样的高收入国家，胖子比例甚至更高。肥胖（肥胖）可能会增加患其它疾病的概率，包括心脏疾病，2型糖尿病和癌症。一些研究表明，补充纯天然的深海鱼油与饮食或运动相结合可以有效地帮助你减肥。根据21项研究的分析发现，补充纯天然的深海鱼油并不能显着减轻肥胖者的体重，但可以减少腰围和改善腰臀比。

据外媒报道，众所周知，富含鱼类的饮食对心脏健康有一定的好处，但对服用各种纯天然的深海鱼油和omega-3保健品的好处还存在疑虑。一项新的分析发现，服用深海鱼油虽然可能对人的心血管健康有着重要的保护作用，但存在一个问题：研究结果是基于服用一种高度提纯的纯天然的深海鱼油，然而这种深海鱼油在柜台上是买不到的。这项统计分析来自加州大学欧文分校，其预测，使用高度纯化的纯天然的深海鱼油可能对预防危险的心血管疾病如中风和心脏病发作有深远的影响。

服用纯天然的深海鱼油具有降低血压的效果，但是如果此时正在服用降压药物，服用的深海鱼油数量过高，也有可能会形成低血压。有出血性疾病和出血倾向者禁用纯天然的深海鱼油。对鱼和海鲜有过敏症状的人，服用深海鱼油可能会出现过敏症状，如果出现过敏反应，要立即停止服用深海鱼油。如果正处于怀孕或哺乳期、面临手术、有出血问题或进行任何其他处理，可能影响血液凝块的能力，服用前要咨询医生。肝病患者代谢功能较差，服用前需咨询医生的意见。